Кафедра факультетской и госпитальной терапии была организована в 1920 году в составе медицинского факультета Туркестанского университета.
Первым директором клиники (заведующим кафедрой) с 1920 по 1926 гг. был профессор Александр Николаевич Крюков (1878-1952 г.). В 1926 году произошло отделение факультетской терапевтической клиники. Кафедра госпитальной терапии возглавлялась с 1932 года по 1946 год профессором М.И. Слонимом
С 1946 по 1969 год госпитальной терапевтической клиникой заведовала профессор Зульфия Ибрагимовна Умидова (23 года!). Состав кафедры часто менялся и расширялся. Однако первым заместителем заведующего кафедрой всегда считался зав. учебным процессом. Таким был доцент А.А. Арифджанов. доценты П.И. Федорова, А.Б. Бахадыров, А.Х. Шамирзаев, Л.И. Лазоренко, Р.Х. Коканбаева, Р.А. Канценович, Л.М. Мирочник, А.М. Кочергина, С.В. Абдуллаева, Т.Г. Пальянц, Т.У. Максудханов, Н.Н. Мирзаев составляли костяк кафедры.
З.И. Умидова создала свою школу кардиологов, которая характеризовалась функциональным, экологическим и социальным направлениями. В клинике всегда царили образцовый порядок, дисциплина и чистота. Интерьер клиники и палаты оборудовал дизайнер. Зульфия Ибрагимовна следила за состоянием оборудования. В клинике постоянно вводились новые методы исследования. Так были введены баллистокардиография, векторкардиография. Был применен мингограф «Элема» с велоэргометром; широко применялись методы ЭКГ с дозированной физической нагрузкой (велоэргометрия, пробы Мастера), широко использовали ФКГ (итальянский аппарат «Galileo»). Из рентгенологических методов – многоцелевая томография сердца. Впервые был установлен аппарат для исследования кислотно-щелочного равновесия. Функционировали кислородные палаты с централизованной подачей кислорода.
В 1965 году кафедра была дислоцирована в клиническую больницу МЗРУз и занимала III, IV и V этажи, всего – 240 коек терапевтического отделения. Это была современная хорошо оснащенная больница со всеми специализированными отделениями и лабораториями.
С 1970 по 1971 год заведующей кафедрой была избрана М.С. Турсунходжаева (1921-1976 гг.). М.С. Турсунходжаева хорошо знала учебный процесс – была деканом педиатрического факультета. Опытный терапевт, была консультантом главного IV лечебного управления РЗРУз. Была деканом педиатрического факультета в 1967-1969 гг. с 1961 по 1968 год – заведующая кафедрой пропедевтики внутренних болезней стоматологического факультета.
В 1971-1977 годах кафедру госпитальной терапии возглавил профессор Р.А. Каценович (1920 года рождения). В 1945 окончил ТашМИ, защитил кандидатскую диссертацию в 1947 году в аспирантуре при этой же кафедре, докторскую в 1964 году («Гидроаэроинотерапия больных ревматизмом»). Заслуженный деятель науки УзССР, главный консультант IV главного управления МЗУзССР, долгое время был заместителем директора по науке НИИ физиотерапии и курортологии им Семашко. Опубликовал 5 монографий в основном по курортологии, физиотерапии и по кардиологии «Застойная недостаточность кровообращения», член-корреспондент АНУзССР. Р.А. Каценовича отличала высокая культура, дисциплина, трудолюбие. Он много уделял учебному процессу, особенно методической работе и работе со студентами, активно действовал студенческий научный кружок, систематически проводились олимпиады по специальности.
В 1976 году на базе госпитальной терапевтической клиники была создана научная группа по кардиологии, а в 1977 году был создан институт кардиологии МЗУзССР. Научное направление кафедры в это время было кардиологическое; исследования проводились по проблеме фармакотерапии ИБС в основном бета-блокаторами.
В 1977 году от ТашМИ отделился II медицинский институт, куда перешел со всей кардиологической группой профессор Р.А. Каценович, где им была создана оригинальная кардиологическая школа. Сам Р.А. Каценович подготовил 14 докторов и 50 кандидатов медицинских наук. Награжден орденом «Знак Почета» и «Дружбы Народов». Кафедра госпитальной терапии осталась на своем месте в составе I ТашМИ и именовалась «Кафедра госпитальной терапии II лечебного факультет с курсом военно-полевой терапии». Заведующей кафедрой была избрана профессор Х.И. Янбаева, зав. курсом ВПТ – профессор Р.А. Карабаева.
Техническая оснащенность кафедры была удовлетворительной. В качестве второй базы кафедры была утверждена КБСНМП (Клиническая больница скорой неотложной медицинской помощи). Исключительную роль в освоении этой клинической базы принадлежала доценту, а вскоре профессору Аляви А.Л. Техническая оснащенность была удовлетворительной, на обеих базах имелась ультразвуковая аппаратура (японского производства), рентгенологическая служба, имелось достаточное количество портативных электрокардиографов для студентов. На базе КБ №1 УзМинздрава производилась пункционная биопсия почек, радионуклеидные методы исследования. Функционировали биохимическая, клиническая и иммунологическая лаборатории. Обеспечивалась возможность госпитализации тематических больных.
С 1991 года с началом глубоких социальных преобразований в Узбекистане и обретением им независимости состоялся новый этап в истории госпитальной терапевтической кафедры и клиники I ТашГосМИ. Принципиально изменились все направления деятельности кафедры: научной деятельности, произошла перестройка учебного процесса, совершенствовалась работа со студентами и характер общественной деятельности. 2 сентября 1991 года к заведованию кафедрой госпитальной терапии приступил профессор Аляви Анис Лутфуллаевич (1947 года рождения), профессор этой же кафедры.
В 2012-2013 учебном году зав. кафедрой проф. Аляви А.Л. перешел на должность профессора кафедры, а кафедру возглавил его ученик – докторант Маматкулов Х.А., который раньше работал в кафедре на должности доцента.